Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NKX1-1Q15270 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms