Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms