Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms