Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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RNF20Q5VTR2 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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RNF20Q5VTR2 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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RNF20Q5VTR2 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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RNF20Q5VTR2 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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RNF20Q5VTR2 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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RNF20Q5VTR2 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RNF20Q5VTR2 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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