Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRNQ16849 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPRNQ16849 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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PTPRNQ16849 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRNQ16849 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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