Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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FOXD1Q16676 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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FOXD1Q16676 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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FOXD1Q16676 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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FOXD1Q16676 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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FOXD1Q16676 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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FOXD1Q16676 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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FOXD1Q16676 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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FOXD1Q16676 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXD1Q16676 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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