Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
E2F4Q16254 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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