Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
UBE4AQ14139 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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UBE4AQ14139 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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UBE4AQ14139 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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