Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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TRAF3Q13114 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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TRAF3Q13114 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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TRAF3Q13114 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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TRAF3Q13114 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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TRAF3Q13114 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAF3Q13114 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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