Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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TRAF1Q13077 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAF1Q13077 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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