Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms