Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms