Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP3Q9UKI2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms