Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GGA1Q9UJY5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms