Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED13Q9UHV7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms