Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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