Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD3Q9NYL9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms