Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms