Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L1Q9NU39 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms