Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms