Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB1BQ9H0U4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms