Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCL11BQ9C0K0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCL11BQ9C0K0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms