Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms