Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN18Q99952 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms