Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSRNP1Q96S65 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms