Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCHS1Q96JQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms