Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BCANQ96GW7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BCANQ96GW7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BCANQ96GW7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BCANQ96GW7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCANQ96GW7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms