Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms