Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP9XQ93008 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms