Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC9Q8TBE3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC9Q8TBE3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms