Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF554Q86TJ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF554Q86TJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms