Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTF1AQ7RTS3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTF1AQ7RTS3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms