Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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