Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms