Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM29Q5VYK3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms