Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRCH2Q5VUJ6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms