Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYOM3Q5VTT5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MYOM3Q5VTT5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms