Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms