Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms