Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAVIN4Q5BKX8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms