Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms