Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA3Q16787 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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