Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CCDC85BQ15834 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC85BQ15834 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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