Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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BRD3Q15059 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD3Q15059 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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