Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
POLD3Q15054 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLD3Q15054 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms