Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNTB1Q13884 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNTB1Q13884 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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