Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P11Q13670 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PMS2P11Q13670 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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