Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDH18Q13634 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms