Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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