Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATRQ13535 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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